Avogadro
adalah software kimia gratis, open source, tersedia dalam berbagai
paltform sistem operasi merupakan editor molekul yang dirancang untuk
digunakan secara fleksibel dalam kimia komputasi, pemodelan molekul,
bioinformatika, ilmu material, dan bidang terkait lainnya. Avogadro yang
tersedia dapat dijalankan pada sistem Windows, Linux, dan Mac OS X.
Kode sumber sumber tersedia di bawah GPL GNU. Menurut saya aplikasi ini
sangat bagus dengan kelebihan ukuran filenya sangat kecil (tidak lebih
dari 10 MB). Tampilan yang bagus dan sudah bisa dihandle oleh perangkat
keras kebanyakan sekarang.
Apa yang dapat dilakukan Avogadro?
- Dapat melakukan pengunduhan secara langsung dari PDB (protein data bank) atau PubChem (database dari molekul kimia dan aktivitasnya terhadap uji biologis).
-
Inovatif “auto-optimation”, alat yang memungkinkan Anda untuk terus membangun dan memodifikasi, selama optimasi mekanika molekular.
-
Antarmuka untuk banyak paket komputasi umum.
- Plugin yang memungkinkan Avogadro untuk diperpanjang dan disesuaikan.
- Embedded interpreter Python.
- Terjemahan tersedia dalam 19 bahasa lebih, termasuk antar muka juga sudah bisa berbahasa Indonesia, tersisa hanya beberapa bagian saja yang belum dialihbahasakan.
- Cross-Platform: Molekul pembangun / editor untuk Windows, Linux, dan Mac OS X.
- Intuitif: Dibangun untuk dapat digunakan dengan mudah bagi mahasiswa dan peneliti lebioh lanjut.
Bagaimana cara menggunakannya ?
1. Pertama kita buka aplikasi Avogadro maka akan mucul tampilan sebagai berikut ini.
2.Bila dirasa background hitam dirasa kurang menarik maka kita bias merubahnya dengan cara View menu → set background color. Pilih warnayang Anda kehendaki.
3.
Untuk memulai membuat bentuk molekul, pertama adalah klik tool
settings. Kemudian baut garis dilayar makan akan terbentuk struktur
molekeku.
4.
Untuk mengubah tampilanm dari molekul kita dapat mengubahnya di
pengarutan alat bantu, maka akan terdapat banyak pilihan disisni juga
dapat digunakan unsure karbon dan jenis ikatan dari molekul
Missal molekul diubah menjadi Van Der Waals adalah sebagaui berikut
Cara Instal progam ini ada beberapa cara yaitu
1. Membuka terminal dengan cara ketik Ctrl+Alt+T
Sudo apt-get update
Sudo apt-get install Avogadro
2. Membuka Ubuntu Software →Scince & Engineering→Chemistry→Avogadro
sumber :
No comments:
Post a Comment